1. Die Tobi-Identitätstheorie:

Während des Großen Ninja-Kriegs wurde Tobi als einer der Hauptantagonisten vorgestellt. Viele Fans spekulierten über seine wahre Identität, da er sein Gesicht hinter einer Maske verbarg. Eine weitverbreitete Theorie war, dass Tobi niemand anderer als Uchiha Obito war, ein ehemaliger Freund von Kakashi, der scheinbar in einem Felsen begraben wurde. Diese Theorie erregte viel Aufmerksamkeit, und schließlich wurde sie bestätigt, als die Maske gefallen ist und Obito sich als Tobi herausstellte.

2. Die "Naruto ist ein Reinkarnations-Avatar" Theorie:

Diese Theorie stammt aus der Enthüllung von Hagoromo Ōtsutsuki, dem ersten Shinobi, der die Macht des Rinnegan besaß. Er erklärte, dass er und sein Bruder Hamura Reinkarnations-Avatare des Rikudō Sennin (dem Urahn der Shinobi) sind. Einige Fans spekulierten, dass Naruto und Sasuke möglicherweise Reinkarnations-Avatare von Hagoromo und Hamura sind, was ihre beispiellosen Kräfte und Schicksale erklären könnte. Diese Theorie wurde in gewisser Weise bestätigt, als sich herausstellte, dass Naruto und Sasuke die Reinkarnationen von Asura und Indra, den Söhnen von Hagoromo, sind.

3. Die Rinnegan Theorie:

Während der Laufzeit von Naruto gab es viele Theorien über das Rinnegan, ein mächtiges Auge, das zwischen dem Sharingan und dem Byakugan steht. Einige dieser Theorien umfassten die Idee, dass das Rinnegan ein Erbe der Ōtsutsuki ist, insbesondere von Kaguya Ōtsutsuki. Eine andere verbreitete Theorie war, dass das Rinnegan eine Weiterentwicklung des Sharingan ist, was durch Charaktere wie Sasuke unterstützt wurde, die vom Sharingan zum Rinnegan übergingen. Die Kräfte des Rinnegan, insbesondere die sechs Pfade, wurden als bedeutende Elemente der Handlung betrachtet. Insgesamt wurden viele dieser Theorien durch die Enthüllungen gegen Ende von Naruto Shippuden bestätigt oder widerlegt, als mehr über die Hintergrundgeschichte der Ōtsutsuki und das Rinnegan enthüllt wurde.

Das Rinnegan gilt als das mächtigste der drei großen Dojutsu und hat seinen Ursprung in der Ōtsutsuki-Familie, einer besonders mächtigen Gruppe von Wesen. Hagoromo Ōtsutsuki, auch bekannt als der Rikudō Sennin, war der erste Träger des Rinnegan. Er entwickelte es, indem er das Chakra seiner Mutter, Kaguya Ōtsutsuki, erhielt, die ebenfalls das Rinnegan besaß.

Es wurde offenbart, dass das Rinnegan eine Weiterentwicklung des Sharingan ist. Ein Beispiel dafür ist Sasuke Uchiha, der das Sharingan besaß und nach bestimmten Ereignissen das Rinnegan entwickelte.

Die Fähigkeiten des Rinnegan sind besonders vielfältig und mächtig, darunter die Kontrolle über die "Sechs Pfade des Schmerzes". Dies beinhaltet die Beherrschung von Leben und Tod, die Fähigkeit, Tote wiederzubeleben, und die Manipulation von Seelen.

Das Rinnegan kann durch direkte Übertragung des Chakras von einem Träger auf einen anderen weitergegeben werden, was erklärt, wie es von Generation zu Generation weitergegeben wurde.

Diese Informationen wurden im Verlauf der Serie enthüllt, insbesondere gegen Ende von Naruto Shippuden, wenn die Hintergrundgeschichte der Ōtsutsuki-Familie und die Ursprünge des Rinnegan genauer erklärt wurden.